对输入的检索词，首先在多个索引词表进行搜索、比对，并自动转换为相应的MeSH主题词、著者或刊名，再将检索词在allfields（所有字段）中检索，九把刀照片并执行“OR”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组，则继续将其拆分为单词后分别在allfields（所有字段）中检索，单词之间的逻辑关系为“AND”。
例如，查找“创伤性心跳骤停”的文献，最简单的方法是在检索框中直接输入“traumaticcardiac arrest ”三个词，点击“Search”按钮，即可得到检索结果。
需要注意的是，PubMed检索系统会对输入的检索词进行自动词语匹配，Detail栏目显示PubMed实际执行的检索式：